RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556274.5

ATXN3-237, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 913 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-237ENST00000556274 VIPP01282 170 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 AMY1AP04745 511 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 CKMT1AP12532 417 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 ITGALP20701 1170 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 DDCP20711 480 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 IDSP22304 550 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 RAP2BP61225 183 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 ACTRT1Q8TDG2 376 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 NCSTNQ92542 709 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 COX14Q96I36 57 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.55□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.54□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 LDB2O43679 373 aa4.54□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 GIMD1P0DJR0 217 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 CDK4P11802 303 aa4.54□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 TYRP1P17643 537 aa4.54□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 HALP42357 657 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 ACADVLP49748 655 aa4.54□□□□□ -1.68
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ATXN3-237ENST00000556274 MAPK10P53779 464 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 DCDC1P59894 354 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 DR1Q01658 176 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-237ENST00000556274 CACNG1Q06432 222 aa4.54□□□□□ -1.68
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