RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 HMG20BQ9P0W2 317 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAD2L2Q9UI95 211 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 APPL1Q9UKG1 709 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHKBQ9Y259 395 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A1W2PRV1 198 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 OVOL3O00110 214 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PGRMC2O15173 223 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC22A2O15244 555 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATP9AO75110 1047 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 GLCEO94923 617 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 MT-ND3P03897 115 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 RAF1P04049 648 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 NR3C1P04150 777 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD34CP0C6C1 535 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 THEGLP0DJG4 465 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 TGFB3P10600 412 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL10P22301 178 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 JAK1P23458 1154 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 MARK3P27448 753 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PIK3R1P27986 724 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CETN2P41208 172 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR3A1P47881 315 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 STARD6P59095 220 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CETN1Q12798 172 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPRL3Q12980 569 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPR17Q13304 367 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SGCBQ16585 318 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 UGT3A1Q6NUS8 523 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANO5Q75V66 913 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCTD9Q7L273 389 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRSS42Q7Z5A4 293 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ISCA2Q86U28 154 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 APCDD1Q8J025 514 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 LPCAT1Q8NF37 534 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR13A1Q8NGR1 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 DYRK2Q92630 601 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PYCR2Q96C36 320 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CFAP36Q96G28 342 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 C5orf30Q96GV9 206 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 NSL1Q96IY1 281 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 C4orf45Q96LM5 186 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC5A7Q9GZV3 580 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAGEF1Q9HAY2 307 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 EXOC1Q9NV70 894 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYP39A1Q9NYL5 469 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 STX8Q9UNK0 236 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACEP12821 1306 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 BMPR1BO00238 502 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTI1O43156 1089 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZBTB14O43829 449 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 FGF17O60258 216 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 KERAO60938 352 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CRCPO75575 148 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRDM1O75626 825 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKAP3O75969 853 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SERPING1P05155 500 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM157CP0CG43 387 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PLA2G2AP14555 144 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 LBPP18428 481 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALDH4A1P30038 563 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SFTPDP35247 375 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCNJ1P48048 391 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDH11P55287 796 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 ERVFC1-1P60608 527 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPP38P78345 283 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 MYL7Q01449 175 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 FOLH1Q04609 750 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC34A1Q06495 639 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 C17orf67Q0P5P2 114 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 OPCMLQ14982 345 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPA1Q15181 289 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms