RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509351.5

VNN3-211, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-211ENST00000509351 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 MAGED4Q96JG8 741 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 GNRHR2Q96P88 292 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 PLIN2Q99541 437 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 GPA33Q99795 319 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 SNX25Q9H3E2 840 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 FANCEQ9HB96 536 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 VAT1LQ9HCJ6 419 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 RAB20Q9NX57 234 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 GRID1Q9ULK0 1009 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 PCDHA12Q9UN75 941 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 IRAK3Q9Y616 596 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 XDHP47989 1333 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 RTL1A6NKG5 1358 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 USP47Q96K76 1375 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.09□□□□□ -1.59
VNN3-211ENST00000509351 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 SLC28A1O00337 649 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 YY2O15391 372 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 VPS26AO75436 327 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 RHBDL1O75783 438 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 CIB2O75838 187 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 IL1BP01584 269 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 C9P02748 559 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 MMP10P09238 476 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ST6GAL1P15907 406 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ATP6V1C1P21283 382 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 HSD17B3P37058 310 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ACTR3P61158 418 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 LCP2Q13094 533 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 TP53BP2Q13625 1128 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PTPRRQ15256 657 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 RCN1Q15293 331 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 VSTM1Q6UX27 236 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 FAM124AQ86V42 546 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ANKRD46Q86W74 232 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 UEVLDQ8IX04 471 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PHC2Q8IXK0 858 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 BBOF1Q8ND07 529 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ERGIC1Q969X5 290 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ZNF583Q96ND8 569 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 RASL10BQ96S79 203 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 KLC2Q9H0B6 622 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 OSER1Q9NX31 292 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.09□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 A0A1W2PP64 1363 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 A0A0U1RRA0 63 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 A0A1B0GUL7 405 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 GAGE12BA1L429 117 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 NEMP2A6NFY4 417 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ZNF716A6NP11 495 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 SLC16A5O15375 505 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 OR6A2O95222 327 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ZNF735P0CB33 412 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 UNGP13051 313 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 CPA3P15088 417 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 SSTR4P31391 388 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 OR1G1P47890 313 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 NUDT6P53370 316 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 AIF1P55008 147 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 INHBEP58166 350 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PPP2CBP62714 309 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PPP2CAP67775 309 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 HSF2Q03933 536 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PDIA5Q14554 519 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 DPYSL2Q16555 572 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 AWAT1Q58HT5 328 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.08□□□□□ -1.6
VNN3-211ENST00000509351 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms