RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490439.1

NUP205-208, Transcript of nucleoporin 205, humanhuman

TSL 3

Gene NUP205, Length 653 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205-208ENST00000490439 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 KCNN4O15554 427 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 MFAP3LO75121 409 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CLEC3AO75596 197 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 APOC2P02655 101 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CAPN1P07384 714 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CBSLP0DN79 551 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ITGA3P26006 1051 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 PSMB4P28070 264 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 SHMT2P34897 504 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CBSP35520 551 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 DCTP40126 519 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CETN2P41208 172 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CD151P48509 253 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 PER3P56645 1201 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 RIPPLY3P57055 190 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 RPA4Q13156 261 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 OLIG2Q13516 323 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 MYBPC3Q14896 1274 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 BRD3Q15059 726 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 GPR33Q49SQ1 333 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 DCAF10Q5QP82 559 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CNGA4Q8IV77 575 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 Q8N1X5 172 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 GBP5Q96PP8 586 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 GOLPH3Q9H4A6 298 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 INTUQ9ULD6 942 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ASF1AQ9Y294 204 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ALG6Q9Y672 507 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CENPEQ02224 2701 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ITPR2Q14571 2701 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.29□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 A0A0J9YY10 115 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CCDC78A2IDD5 438 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ISM1B1AKI9 464 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 F8W8V4 182 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 QSOX1O00391 747 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CCL22O00626 93 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 SGTAO43765 313 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CBX6O95503 412 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 FTH1P02794 183 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 UQCRHP07919 91 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 GSTM1P09488 218 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 UGT2B7P16662 529 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ACRV1P26436 265 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 PDHA2P29803 388 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 MAGEA1P43355 309 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 MARCKSL1P49006 195 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 XIAPP98170 497 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 SPARCL1Q14515 664 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 SPA17Q15506 151 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 TAZQ16635 292 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 RANBP10Q6VN20 620 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 BBS12Q6ZW61 710 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 ELMO1Q92556 727 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 DLG3Q92796 817 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 PTERQ96BW5 349 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 VPS50Q96JG6 964 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 CNDP1Q96KN2 507 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 NRTNQ99748 197 aa7.28□□□□□ -1.24
NUP205-208ENST00000490439 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms