RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	P3H4	Q92791	437 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26	2e-6	■■□□□ 13.3
SHOC2-205	ENST00000489390	MIPEP	Q99797	713 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	LRFN1	Q9P244	771 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390		H0YGG7	62 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	PSMB5	P28074	263 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CDKN2B	P42772	138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	EXT1	Q16394	746 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	STX1A	Q16623	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ACAD11	Q709F0	780 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	LGI4	Q8N135	537 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	NUDT8	Q8WV74	236 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	CYTH2	Q99418	400 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SHOC2-205	ENST00000489390	DNAJC13	O75165	2243 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390		F8W8V4	182 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	FOXS1	O43638	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	MAN1A2	O60476	641 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	PHF2	O75151	1096 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	VPS26A	O75436	327 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A12	O75746	678 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	TYRO3	Q06418	890 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC5A8	Q8N695	610 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	MMP25	Q9NPA2	562 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	GPC4	O75487	556 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	TFEB	P19484	476 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	CCR7	P32248	378 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	NUP107	P57740	925 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	PMPCA	Q10713	525 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	PRPSAP1	Q14558	356 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	KAZN	Q674X7	775 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	RPRML	Q8N4K4	120 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	DRC3	Q9H069	523 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	ALG6	Q9Y672	507 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A1B0GTH6	734 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	PRMT3	O60678	531 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	PSMB4	P28070	264 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	AGTR2	P50052	363 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	DLX5	P56178	289 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	TAS2R50	P59544	299 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM53B	Q14153	422 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	HKDC1	Q2TB90	917 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SHOC2-205	ENST00000489390	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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