RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CSNK1A1LQ8N752 337 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 FKBP10Q96AY3 582 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PTERQ96BW5 349 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CABS1Q96KC9 395 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 OR2A5Q96R48 311 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa22.89■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MED26O95402 600 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ONECUT2O95948 504 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CCND1P24385 295 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEA4P43358 317 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CCL11P51671 97 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 FOXL2P58012 376 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GPX6P59796 221 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ATP1A4Q13733 1029 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MUM1Q2TAK8 710 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CYS1Q717R9 158 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 C17orf64Q86WR6 236 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PLD3Q8IV08 490 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 IKZF3Q9UKT9 509 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MAU2Q9Y6X3 613 aa22.88■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 FAM159BA6NKW6 160 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GUCA1CO95843 209 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ALBP02768 609 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 COX15Q7KZN9 410 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MRGPREQ86SM8 312 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CEP97Q8IW35 865 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ATL1Q8WXF7 558 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 COL26A1Q96A83 441 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 IP6K3Q96PC2 410 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CPNE1Q99829 537 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SGPP1Q9BX95 441 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 WDR54Q9H977 334 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GPAMQ9HCL2 828 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MED13Q9UHV7 2174 aa22.87■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TXNDC9O14530 226 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TUBB4AP04350 444 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 NR1D1P20393 614 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 EMP3P54852 163 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 RRADP55042 308 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 POU4F1Q01851 419 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GUCY2DQ02846 1103 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 NKG7Q16617 165 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 HKDC1Q2TB90 917 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 LCTLQ6UWM7 567 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SBSNQ6UWP8 590 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MED25Q71SY5 747 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MNS1Q8NEH6 495 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL8Q96CD0 374 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 C10orf90Q96M02 699 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.86■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 K7EM74 188 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CDC7O00311 574 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PEX12O00623 359 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SUV39H1O43463 412 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 UMODP07911 640 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GP5P40197 560 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 OR56A3Q8NH54 315 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD7Q92527 254 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PYCR2Q96C36 320 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 RBBP8Q99708 897 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 HAUS8Q9BT25 410 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CTSFQ9UBX1 484 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.85■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CDH1P12830 882 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 NPPBP16860 134 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 STX2P32856 288 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CSNK1G2P78368 415 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GARNL3Q5VVW2 1013 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms