RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CRISP3P54108 245 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TEKQ02763 1124 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPSQ13938 189 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC14A2Q15849 920 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF79Q15937 498 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD11Q693B1 232 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 DYRK4Q9NR20 520 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 ALPPP05187 535 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGDIAP52565 204 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SCN1BQ07699 218 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2H3Q13889 308 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 QPRTQ15274 297 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DDR2Q16832 855 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 HECTD3Q5T447 861 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMCX2Q7L311 632 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPV1Q8NER1 839 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T12Q8NG77 320 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10A6Q8NH74 314 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 NRIP1P48552 1158 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 CREMQ03060 361 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF33BQ06732 778 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 TIGD4Q8IY51 512 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0355O15063 1070 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PI15O43692 258 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1BO75688 479 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC19A1P41440 591 aa8.15□□□□□ -1.1
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