RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRCPP42785 496 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM27E3Q08E93 113 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC10A1Q14973 349 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CBWD6Q4V339 395 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SARM1Q6SZW1 724 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIGMQ9H3S5 423 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD8B2A6NJW9 211 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLF4O43474 513 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ESR1P03372 595 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 P3H1Q32P28 736 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBF1Q8TES7 1133 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM168AQ92567 244 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KAT5Q92993 513 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PANK2Q9BZ23 570 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EXO5Q9H790 373 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FFAR3O14843 346 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR42O15529 346 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX16P57768 344 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMPD3Q01432 767 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL10RBQ08334 325 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GSE1Q14687 1217 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDK1Q15118 436 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCTP1Q6DN14 999 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELP5Q8TE02 316 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYTH2Q99418 400 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XKR8Q9H6D3 395 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLCE1Q9P212 2302 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FCHO1O14526 889 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KPNA5O15131 536 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP6AP2O75787 350 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TPSB2P20231 275 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NR2F2P24468 414 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCKARP32238 428 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPOXP36551 454 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DIO3P55073 304 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TPSAB1Q15661 275 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRNP1Q6NT89 227 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PGBD5Q8N414 524 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX31Q8N9S9 440 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAVIN3Q969G5 261 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBE2FQ969M7 185 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXW5Q969U6 566 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS35Q96QK1 796 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MGME1Q9BQP7 344 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FEZF1A0PJY2 475 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R3DO95685 299 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPN6P29350 595 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC26A3P40879 764 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL13RA1P78552 427 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOXF2Q12947 444 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms