RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412585.6

HLA-B-249, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HLA-B, Length 1,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-249ENST00000412585 ICKQ9UPZ9 632 aa16.09■□□□□ 0.17
HLA-B-249ENST00000412585 POMPQ9Y244 141 aa16.09■□□□□ 0.17
HLA-B-249ENST00000412585 RP1P56715 2156 aa16.09■□□□□ 0.17
HLA-B-249ENST00000412585 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
HLA-B-249ENST00000412585 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 KRT87PA6NCN2 255 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 SH3BP5O60239 455 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 KLK8O60259 260 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 IMPA1P29218 277 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 PFKFB4Q16877 469 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 MUM1Q2TAK8 710 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 GUSBP11Q6P575 273 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 C16orf89Q6UX73 402 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 OOSP2Q86WS3 158 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 SNX32Q86XE0 403 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CCNYL1Q8N7R7 359 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 OR10G6Q8NH81 332 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CEP70Q8NHQ1 597 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 AGR3Q8TD06 166 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 IL17FQ96PD4 163 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CDC6Q99741 560 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 NDE1Q9NXR1 346 aa16.08■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ERGP11308 486 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 MYF5P13349 255 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CKMT2P17540 419 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 AMD1P17707 334 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ALDH4A1P30038 563 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ATP4BP51164 291 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 GPLD1P80108 840 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 NR1D2Q14995 579 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CYP2A13Q16696 494 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 UNC50Q53HI1 259 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 NETO1Q8TDF5 533 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF480Q8WV37 535 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 MED8Q96G25 268 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 XKR8Q9H6D3 395 aa16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 TMEM233B4DJY2 109 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 STX16O14662 325 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 DUX1O43812 170 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 KRT34O76011 436 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 UBXN7O94888 489 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 PROS1P07225 676 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CD1EP15812 388 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 TBPL1P62380 186 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 HERVK_113P63132 956 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 PIGGQ5H8A4 983 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 IRGCQ6NXR0 463 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CUZD1Q86UP6 607 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 IFI44Q8TCB0 444 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 SMPDL3AQ92484 453 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 MENTQ9BUN1 341 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 U3KQA8 63 aa16.06■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 GSAPA4D1B5 854 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 A6NHS1 94 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 MAP3K7O43318 606 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 FGF4P08620 206 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 ACP1P24666 158 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 CAPZBP47756 277 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 SESN3P58005 492 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 NAE1Q13564 534 aa16.05■□□□□ 0.16
HLA-B-249ENST00000412585 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms