RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIAA1191Q96A73 305 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DACH2Q96NX9 599 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WDFY2Q96P53 400 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BTBD10Q9BSF8 475 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUP85Q9BW27 656 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 APOL5Q9BWW9 433 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EPB41L5Q9HCM4 733 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HHATLQ9HCP6 504 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A4GALTQ9NPC4 353 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C20orf141Q9NUB4 165 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COPG2Q9UBF2 871 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CACNG4Q9UBN1 327 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRDM4Q9UKN5 801 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCPG1Q9ULG6 757 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WSB1Q9Y6I7 421 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CACNA1DQ01668 2161 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SDK2Q58EX2 2172 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RRN3P2A6NIE6 340 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ENO4A6NNW6 628 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 K7EQG2 157 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 INPP4BO15327 924 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPAA1O43292 621 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNFSF12O43508 249 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CAND2O75155 1236 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRT38O76015 456 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLITRK3O94933 977 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEMA4FO95754 770 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACP2P11117 423 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SKILP12757 684 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EEF2P13639 858 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COX7A2P14406 83 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDH3P22223 829 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNFSF4P23510 183 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CST5P28325 142 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPL9P32969 192 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSMD8P48556 350 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LIG4P49917 911 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRYBA2P53672 197 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HMGCS2P54868 508 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDC16Q13042 620 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRKAA1Q13131 559 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SQLEQ14534 574 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPNMBQ14956 572 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANKRD1Q15327 319 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAB2Q15742 525 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SGCBQ16585 318 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ODF4Q2M2E3 257 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GFOD2Q3B7J2 385 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FBXO47Q5MNV8 452 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GALNT17Q6IS24 598 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MFSD7Q6UXD7 560 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SYVN1Q86TM6 617 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COMMD2Q86X83 199 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEND1Q8N111 149 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAGEB6Q8N7X4 407 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC37A3Q8NCC5 494 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR6T1Q8NGN1 323 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR1B1Q8NGR6 318 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MOSPD2Q8NHP6 518 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FBXO30Q8TB52 745 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STYXQ8WUJ0 223 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 JDP2Q8WYK2 163 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RMI2Q96E14 147 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM41AQ96HV5 264 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM218AQ96MZ4 157 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHODLQ9H9P2 273 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ITGA11Q9UKX5 1188 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RNF123Q5XPI4 1314 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADGRL1O94910 1474 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A1W2PRG0 241 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NKX6-3A6NJ46 265 aa-0.23□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms