RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 EPORP19235 508 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CDKN2CP42773 168 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 NRIP1P48552 1158 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 TRPC1P48995 793 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 RACK1P63244 317 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LMAN2Q12907 356 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 GTF2H3Q13889 308 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC66Q68CR7 880 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 DOK6Q6PKX4 331 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 RFLNAQ6ZTI6 216 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT5Q7Z7M9 940 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 P2RY8Q86VZ1 359 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 OR52E4Q8NGH9 312 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB8Q8NHS0 232 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CNIH3Q8TBE1 160 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ATL1Q8WXF7 558 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 AUTS2Q8WXX7 1259 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 MAGIXQ9H6Y5 334 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 GPRC5BQ9NZH0 403 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 FAM172BPA6NC97 362 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 RFXANKO14593 260 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CBSLP0DN79 551 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PRPS2P11908 318 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PRKCAP17252 672 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CD70P32970 193 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CBSP35520 551 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 STK19P49842 368 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 IL5RAQ01344 420 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 TTC23LQ6PF05 361 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC81Q6ZN84 652 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZNB5 142 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CALHM3Q86XJ0 350 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 HIPK1Q86Z02 1210 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC103Q8IW40 242 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 RORBQ92753 470 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 YIPF6Q96EC8 236 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 EGLN2Q96KS0 407 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 APOLD1Q96LR9 279 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PRM3Q9NNZ6 103 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SERHLQ9NQF3 203 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.79□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 MYO1GB0I1T2 1018 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SCO2O43819 266 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB5O75953 348 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CKMP06732 381 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 OR56A5P0C7T3 313 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CYP4F8P98187 520 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LAPTM4AQ15012 233 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SLX4IPQ5VYV7 408 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 OR4F3Q6IEY1 312 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 TPRG1Q6ZUI0 275 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SPATC1Q76KD6 591 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SIX5Q8N196 739 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 OR2AP1Q8NGE2 309 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 MCOLN3Q8TDD5 553 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 APIPQ96GX9 242 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ERVK-18Q9QC07 812 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PPT2Q9UMR5 302 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ISPDA4D126 451 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 KRT87PA6NCN2 255 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 EVPLLA8MZ36 301 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CENPBD1B2RD01 187 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 BCKDKO14874 412 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 MITFO75030 526 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 MFN2O95140 757 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SOD2P04179 222 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 KRT8P05787 483 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SDC1P18827 310 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ITPKAP23677 461 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PSMB9P28065 219 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 GRK3P35626 688 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CSNK1DP48730 415 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 CLK3P49761 638 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 GZMMP51124 257 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 ISL1P61371 349 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALNT1Q00973 533 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 PTCHD3Q3KNS1 767 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC73Q5JTD7 316 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 BBS7Q8IWZ6 715 aa12.78□□□□□ -0.36
TMOD1-202ENST00000375175 SVOPQ8N4V2 548 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms