RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 MSH3P20585 1137 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ITGB7P26010 798 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 HTR1BP28222 390 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TPTEP56180 551 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 PHC1P78364 1004 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 BTLAQ7Z6A9 289 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF566Q969W8 418 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ACOX2Q99424 681 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 HOXD1Q9GZZ0 328 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM245Q9H330 911 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SACM1LQ9NTJ5 587 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TRANK1O15050 2925 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PP18 115 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SAGE2PA6NJ88 616 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 PSMD11O00231 422 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFS2O75306 463 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 AP2A2O94973 939 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 MPC1LP0DKB6 136 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 HGFP14210 728 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 PPP5CP53041 499 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 MAPK10P53779 464 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 IFITM3Q01628 133 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TRAF3Q13114 568 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 IL18R1Q13478 541 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 RUNX3Q13761 415 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 VRK3Q8IV63 474 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 NRSN1Q8IZ57 195 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 BTN2A2Q8WVV5 523 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 VPS35Q96QK1 796 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 FAM129BQ96TA1 746 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 CD244Q9BZW8 370 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 USE1Q9NZ43 259 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 REV3LO60673 3130 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D3BA6NDS4 549 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC159P0C7I6 412 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 GJA4P35212 333 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 CAMK2BQ13554 666 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 AADATQ8N5Z0 425 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF555Q8NEP9 628 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 PJA1Q8NG27 643 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ZFP90Q8TF47 636 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 GLYATL1Q969I3 302 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 AP2M1Q96CW1 435 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 DHRS1Q96LJ7 313 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 COQ10AQ96MF6 247 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 MYADMQ96S97 322 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 CHID1Q9BWS9 393 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ADNPQ9H2P0 1102 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 IPPKQ9H8X2 491 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 XIRP2A4UGR9 3374 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 M0R3G1 203 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 WNT9AO14904 365 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 OTCP00480 354 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 GSNP06396 782 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 CAPN1P07384 714 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 PCMT1P22061 227 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 GDF5P43026 501 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 LIPEQ05469 1076 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 VPS26BQ4G0F5 336 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA19Q7Z5L4 167 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 YAF2Q8IY57 180 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 OR2T11Q8NH01 316 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 DTD2Q96FN9 168 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 NDEL1Q9GZM8 345 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 OPTCQ9UBM4 332 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 ANTXRLA6NF34 631 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 PLK4O00444 970 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 C8GP07360 202 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 IL12RB1P42701 662 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 HTR6P50406 440 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SELPLGQ14242 412 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-204ENST00000352260 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms