RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343380.5

E2F1-201, Transcript of E2F transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1-201ENST00000343380 AGAP5A6NIR3 686 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TBL1XO60907 577 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SLC11A1P49279 550 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 NUDT6P53370 316 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CDC20Q12834 499 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 FAM124AQ86V42 546 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CCDC103Q8IW40 242 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 PAF1Q8N7H5 531 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 NELL1Q92832 810 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 MAL2Q969L2 176 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 C7orf34Q96L11 122 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 GPX2P18283 190 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ITGA1P56199 1179 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 FUT10Q6P4F1 479 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ELMOD1Q8N336 334 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 GPR26Q8NDV2 337 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TRBC1P01850 177 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ITPKAP23677 461 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CSKP41240 450 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 MTAPQ13126 283 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 LACC1Q8IV20 430 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 NXPE1Q8N323 547 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 GABRQQ9UN88 632 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SNX6Q9UNH7 406 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 A0A1W2PQ67 120 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TNFRSF1BP20333 461 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 B4GALNT1Q00973 533 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TIGD6Q17RP2 521 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 VRK3Q8IV63 474 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 PGBD3Q8N328 593 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 MMP27Q9H306 513 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SP140LQ9H930 580 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 M0R129 80 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 DLGAP3O95886 979 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 DNTTP04053 509 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 NTRK1P04629 796 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 KCNJ10P78508 379 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 APCDD1Q8J025 514 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 PLD4Q96BZ4 506 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TTPALQ9BTX7 342 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 RLIMQ9NVW2 624 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 RFPL2O75678 378 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 EPN2O95208 641 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 C9P02748 559 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 LAMP1P11279 417 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 AOAHP28039 575 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 RRM2P31350 389 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CTSKP43235 329 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 NR4A2P43354 598 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CTRCQ99895 268 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 OR51E2Q9H255 320 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 GPR83Q9NYM4 423 aa20.36■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 TRPC1P48995 793 aa20.35■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.35■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.35■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.35■□□□□ 0.85
E2F1-201ENST00000343380 SYT12Q8IV01 421 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms