RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251424.8

CFHR4-201, Transcript of complement factor H related 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CFHR4, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR4-201ENST00000251424 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 KLC1Q07866 573 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 CDH18Q13634 790 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 ITGA7Q13683 1181 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 WTAPQ15007 396 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 TAB1Q15750 504 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 SNAPC1Q16533 368 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 PHKG1Q16816 387 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 PRR27Q6MZM9 219 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 NOTUMQ6P988 496 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 METTL4Q8N3J2 472 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 Q9H8V8 135 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 CHST11Q9NPF2 352 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 GPR83Q9NYM4 423 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 CTSZQ9UBR2 303 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 ZNF510Q9Y2H8 683 aa3.34□□□□□ -1.87
CFHR4-201ENST00000251424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 GAPVD1Q14C86 1478 aa3.34□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ADAMTS12P58397 1594 aa3.34□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 A0A1W2PPM1 405 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 KRT33AO76009 404 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 LINGO3P0C6S8 592 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 FOLR2P14207 255 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 IL4RP24394 825 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ALDH3A2P51648 485 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 IRX4P78413 519 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 HSPB3Q12988 150 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 PTPN14Q15678 1187 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 GPR33Q49SQ1 333 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 HYIQ5T013 277 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 CASC1Q6TDU7 716 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 OR4K1Q8NGD4 311 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 CALML4Q96GE6 196 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 SEPHS2Q99611 448 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 SDF4Q9BRK5 362 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 PDE7BQ9NP56 450 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 STK26Q9P289 416 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ADGRL1O94910 1474 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa3.33□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 A8MXK9 166 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 CCER2I3L3R5 266 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 LDHCP07864 332 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 RAB40ALP0C0E4 278 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ALOX12P18054 663 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 BCL3P20749 454 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 CD27P26842 260 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 PDHA2P29803 388 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 MTHFRP42898 656 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 DNA2P51530 1060 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 VAMP7P51809 220 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 MYL7Q01449 175 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 CD300CQ08708 224 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 VEZF1Q14119 521 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 MEA1Q16626 185 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 CREBRFQ8IUR6 639 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 TAGAPQ8N103 731 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 APPL2Q8NEU8 664 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 PTERQ96BW5 349 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 C2orf48Q96LS8 159 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 MAP3K3Q99759 626 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 NYXQ9GZU5 481 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 PARLQ9H300 379 aa3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
CFHR4-201ENST00000251424 SWAP70Q9UH65 585 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms