RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	CCKBR	P32239	447 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PRKAA2	P54646	552 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HERVK_113	P63132	956 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HSD11B2	P80365	405 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FOXC1	Q12948	553 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GPS2	Q13227	327 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GTF2H2	Q13888	395 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MPP2	Q14168	576 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MECR	Q9BV79	373 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	E2F3	O00716	465 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NRP2	O60462	931 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NEFH	P12036	1026 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GNAZ	P19086	355 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	IMPDH1	P20839	514 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ETV4	P43268	484 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CCR8	P51685	355 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ZIC1	Q15915	447 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	RBBP7	Q16576	425 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CFAP157	Q5JU67	520 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	LIPM	Q5VYY2	423 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MOCOS	Q96EN8	888 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TCTN2	Q96GX1	697 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	OXSM	Q9NWU1	459 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HAT1	O14929	419 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	KATNA1	O75449	491 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	BPGM	P07738	259 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	EBLN1	P0CF75	366 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TSPAN8	P19075	237 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HRH2	P25021	359 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GRK3	P35626	688 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SERPINB4	P48594	390 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NAGLU	P54802	743 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CDH13	P55290	713 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	DNAJB13	P59910	316 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SH3BP2	P78314	561 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	IRF8	Q02556	426 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FOXM1	Q08050	763 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ASPH	Q12797	758 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	UNC50	Q53HI1	259 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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