RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 NCF4Q15080 339 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TTLL9Q3SXZ7 439 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 LCN10Q6JVE6 187 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 WDR93Q6P2C0 686 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 OR1L3Q8NH93 324 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CYTH2Q99418 400 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 OLFM1Q99784 485 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 DHRS7Q9Y394 339 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 E7EQ34 232 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CAPN1P07384 714 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RNF224P0DH78 156 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TPBGLP0DKB5 382 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ST6GAL1P15907 406 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ATP1A4Q13733 1029 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SSPNQ14714 243 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TBC1D21Q8IYX1 336 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 GPR135Q8IZ08 494 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TM9SF4Q92544 642 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 C5orf34Q96MH7 638 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 C2orf74A8MZ97 194 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PEX12O00623 359 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RIPK2O43353 540 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CBX6O95503 412 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 LDLRP01130 860 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SHMT2P34897 504 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 NR6A1Q15406 480 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TRIM73Q86UV7 250 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CPNE9Q8IYJ1 553 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 INPP5DQ92835 1189 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 GPR22Q99680 433 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SPTBP11277 2137 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SEC16AO15027 2179 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CACNA1DQ01668 2161 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ZNF749O43361 778 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FAM155BO75949 473 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CBSLP0DN79 551 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 UGT2B7P16662 529 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 MCM3P25205 808 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 OTX2P32243 289 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CBSP35520 551 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 DCTP40126 519 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PGGT1BP53609 377 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SPESP1Q6UW49 350 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 C19orf60Q96EN9 201 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 POLG2Q9UHN1 485 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 VWA7Q9Y334 891 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK9-211ENST00000557673 NFS1Q9Y697 457 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms