RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555905.5

TMEM260-208, Transcript of transmembrane protein 260, human

TSL 5

Gene TMEM260, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM260-208	ENST00000555905	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CPED1	A4D0V7	1026 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	OR4F21	O95013	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TGDS	O95455	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	UROS	P10746	265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CDH1	P12830	882 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	MYF5	P13349	255 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	UGT2B7	P16662	529 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	DRD4	P21917	467 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CXCR2	P25025	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	HMOX2	P30519	316 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	HNF4A	P41235	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CASP2	P42575	452 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CAPZB	P47756	277 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CCR8	P51685	355 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	OR1D5	P58170	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	GPLD1	P80108	840 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	DAB2	P98082	770 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	DOC2A	Q14183	400 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	NR1D2	Q14995	579 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	KANK2	Q63ZY3	851 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	SPESP1	Q6UW49	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	KRT78	Q8N1N4	520 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	OR2L3	Q8NG85	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	METTL6	Q8TCB7	284 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	RSC1A1	Q92681	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	OR2A14	Q96R47	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	ZMYND15	Q9H091	742 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	SNX7	Q9UNH6	387 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	FRYL	O94915	3013 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905		A0A1B0GTL3	188 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM233	B4DJY2	109 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	HDAC3	O15379	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	DUX1	O43812	170 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	WFS1	O76024	890 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	KRT6A	P02538	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	KRT6B	P04259	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CAPN1	P07384	714 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CKMT1A	P12532	417 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	JUP	P14923	745 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	GRK3	P35626	688 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	KRT6C	P48668	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	IFT88	Q13099	833 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	IRGC	Q6NXR0	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	GUSBP11	Q6P575	273 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	ADCK2	Q7Z695	626 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TMEM260-208	ENST00000555905	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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