RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	HAS2	Q92819	552 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	PEX13	Q92968	403 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	CABS1	Q96KC9	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	DPH7	Q9BTV6	452 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	SERPINA7	P05543	415 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	APRT	P07741	180 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	MST1	P26927	711 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	EMP2	P54851	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	DSG2	Q14126	1118 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	INA	Q16352	499 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	HKDC1	Q2TB90	917 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	AMER3	Q8N944	861 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LETMD1-231	ENST00000551931	KPNA5	O15131	536 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	UNC5C	O95185	931 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	BMP10	O95393	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MATN4	O95460	622 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	WDPCP	O95876	746 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ITGAM	P11215	1152 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ERG	P11308	486 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	FDXR	P22570	491 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CXCR2	P25025	360 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	NMBR	P28336	390 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CMPK1	P30085	196 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNF	P41002	786 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ART3	Q13508	389 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	GBX1	Q14549	363 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PAQR7	Q86WK9	346 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	P2RX6	O15547	441 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXS1	O43638	330 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFS3	O75489	264 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	WISP2	O76076	250 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	HEXB	P07686	556 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	UQCRH	P07919	91 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ARNT	P27540	789 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC26A3	P40879	764 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	EMP3	P54852	163 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PMP22	Q01453	160 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX1	Q13596	522 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF425	Q6IV72	752 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.94	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms