RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 ARL15Q9NXU5 204 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FPGTO14772 594 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CASKO14936 926 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 OR7A10O76100 309 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 OTCP00480 354 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 HPRP00739 348 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FCER2P06734 321 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RGS4P49798 205 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RAB8AP61006 207 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 GPAT3Q53EU6 434 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 LUZP2Q86TE4 346 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SNX18Q96RF0 628 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 TCF25Q9BQ70 676 aa11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CLIC1O00299 241 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PRAMEF10O60809 474 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PCSK1P29120 753 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SCNN1GP51170 649 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 UGT2B15P54855 530 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 VLDLRP98155 873 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FGFBP1Q14512 234 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 ALFQ53S48 1182 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 NLRP8Q86W28 1048 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM69Q86WT6 500 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RNF175Q8N4F7 328 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 OR10G2Q8NGC3 310 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 NELL1Q92832 810 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 MED30Q96HR3 178 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 TREX1Q9NSU2 369 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FBXO10Q9UK96 956 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF487B1APH4 448 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FPR1P21462 350 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PCMT1P22061 227 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SSTR2P30874 369 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SMSP52788 366 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 TBX4P57082 545 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CDC42P60953 191 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 C1DQ13901 141 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 BAK1Q16611 211 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 LINGO4Q6UY18 593 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 OR7D4Q8NG98 312 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RIT1Q92963 219 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 NACC2Q96BF6 587 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CHIAQ9BZP6 476 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SOCS7O14512 581 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 FGF4P08620 206 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 GRK5P34947 590 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 VEPH1Q14D04 833 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CPZQ66K79 652 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 C22orf42Q6IC83 251 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 MOB2Q70IA6 237 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RDH12Q96NR8 316 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CLN6Q9NWW5 311 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.63□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 EVPLQ92817 2033 aa11.62□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 EPB42P16452 691 aa11.62□□□□□ -0.55
PRRX1-207ENST00000497230 KIR3DL1P43629 444 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms