RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	CLCN4	P51793	760 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	UFM1	P61960	85 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ASPH	Q12797	758 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SGCB	Q16585	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	AANAT	Q16613	207 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	STARD8	Q92502	1023 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ESR2	Q92731	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PTER	Q96BW5	349 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GAD1	Q99259	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TSG101	Q99816	390 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	AFF2	P51816	1311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MYH1	P12882	1939 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592		A0A087WV48	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PDLIM1	O00151	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SYN3	O14994	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	LRRTM2	O43300	516 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	AVIL	O75366	819 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MFN2	O95140	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	BAG3	O95817	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GNA14	O95837	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	KLKB1	P03952	638 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GBA	P04062	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	YES1	P07947	543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	FH	P07954	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CYP3A4	P08684	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CLTA	P09496	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	NUDT17	P0C025	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ITIH1	P19827	911 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	AGA	P20933	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CASP1	P29466	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	HTR2B	P41595	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MMP13	P45452	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GNAQ	P50148	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SOX10	P56693	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TAS2R40	P59535	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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