RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PLXDC1Q8IUK5 500 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCNYL1Q8N7R7 359 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MED8Q96G25 268 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZNF382Q96SR6 550 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MECRQ9BV79 373 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GSTO2Q9H4Y5 243 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PELI2Q9HAT8 420 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SNX7Q9UNH6 387 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 KLK4Q9Y5K2 254 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TMEM131Q92545 1883 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PPV9 198 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TNFSF14O43557 240 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 FGF4P08620 206 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G2AP14555 144 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GSTM2P28161 218 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HNF4AP41235 474 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 AGTR2P50052 363 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCNG1P51959 295 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 E2F1Q01094 437 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ICE2Q659A1 982 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TEX9Q8N6V9 391 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SNX31Q8N9S9 440 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SLC39A7Q92504 469 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 UBE2E3Q969T4 207 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GRAMD1AQ96CP6 724 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 WDR34Q96EX3 536 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 IL17FQ96PD4 163 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 XKR8Q9H6D3 395 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 IPPKQ9H8X2 491 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PFDN4Q9NQP4 134 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HAO1Q9UJM8 370 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 U3KQA8 63 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 WDR91A4D1P6 747 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ISM1B1AKI9 464 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 BTN3A3O00478 584 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MAP3K7O43318 606 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SNNO75324 88 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CLDN9O95484 217 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ESRRBO95718 433 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HSPA4LO95757 839 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ENO1P06733 434 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 BGNP21810 368 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ALDH4A1P30038 563 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB1P30740 379 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GDF5P43026 501 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SLC1A6P48664 564 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ATG9BQ674R7 924 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SPESP1Q6UW49 350 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SPRED1Q7Z699 444 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KMT5CQ86Y97 462 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KRT78Q8N1N4 520 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 L3MBTL4Q8NA19 623 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR2L3Q8NG85 312 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms