RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-215ENST00000487620 RUBCNLQ9H714 662 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SP140LQ9H930 580 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 IL26Q9NPH9 171 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 KRT87PA6NCN2 255 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 K7ERQ8 282 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 COCHO43405 550 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 EPN2O95208 641 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 KCNK5O95279 499 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 EPORP19235 508 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ACRV1P26436 265 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 AQP1P29972 269 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 FADDQ13158 208 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 GPR17Q13304 367 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 KCNA10Q16322 511 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ELMOD1Q8N336 334 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 MMP27Q9H306 513 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SLC32A1Q9H598 525 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 HCSTQ9UBK5 93 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SNX6Q9UNH7 406 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RNF6Q9Y252 685 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 AGAP5A6NIR3 686 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 PSMD11O00231 422 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 INPPL1O15357 1258 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 FZD6O60353 706 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 STC2O76061 302 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 EOMESO95936 686 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 NUDT6P53370 316 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ZXDBP98169 803 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.897e-10■■■■□ 23.2
ZNF3-215ENST00000487620 CHRNA6Q15825 494 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TIGD6Q17RP2 521 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ADGRF1Q5T601 910 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SYT12Q8IV01 421 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TRIB2Q92519 343 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 WBP2Q969T9 261 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TESCQ96BS2 214 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 EHD1Q9H4M9 534 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ISPDA4D126 451 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 METTL15A6NJ78 407 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ASNA1O43681 348 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RFPL2O75678 378 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 KCNK2O95069 426 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SPNP16150 400 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ALOX12P18054 663 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 MAPK1P28482 360 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 S100A5P33763 92 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CTSKP43235 329 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TUBA1BP68363 451 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CYP4F2P78329 520 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CDC20Q12834 499 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RTP2Q5QGT7 225 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 HECTD3Q5T447 861 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TUBA1AQ71U36 451 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CHST9Q7L1S5 443 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 PTOV1Q86YD1 416 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 LACC1Q8IV20 430 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RDH14Q9HBH5 336 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 M0R082 166 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 TBL1XO60907 577 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 C9P02748 559 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 SEMG1P04279 462 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 COX7A2P14406 83 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 BPIP17213 487 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ITPKAP23677 461 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 RRM2P31350 389 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 NR4A2P43354 598 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-215ENST00000487620 ITGA1P56199 1179 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms