RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 C9J4A7 227 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJA2O60884 412 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LHCGRP22888 699 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RAD23AP54725 363 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ADPRHP54922 357 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OTULINQ96BN8 352 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PDE7BQ9NP56 450 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT14O95848 222 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 JUPP14923 745 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MPIP34949 423 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EMX2Q04743 252 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EPGNQ6UW88 154 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CYGBQ8WWM9 190 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DPH7Q9BTV6 452 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KCNH6Q9H252 994 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0G2JN53 185 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SDC3O75056 442 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KLK1P06870 262 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CD9P21926 228 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CD27P26842 260 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SEPHS1P49903 392 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 BTN3A2P78410 334 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CTBSQ01459 385 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PTPRRQ15256 657 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PROSER1Q86XN7 944 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EID3Q8N140 333 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EDAQ92838 391 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PKP4Q99569 1192 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 STRADBQ9C0K7 418 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR51B5Q9H339 312 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 H3BNH8 94 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CISD3P0C7P0 127 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFV2P19404 249 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FOXQ1Q9C009 403 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 IL21RQ9HBE5 538 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GTW7 788 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC28A2O43868 658 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PEX11BO96011 259 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA2P17301 1181 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GRIA3P42263 894 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CCR4P51679 360 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ACVR1Q04771 509 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DOC2AQ14183 400 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 HERC3Q15034 1050 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LPAL2Q16609 132 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 HKDC1Q2TB90 917 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.01□□□□□ -1.13
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