RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 CCNFP41002 786 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 KLK7P49862 253 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 MEOX1P50221 254 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 RPA4Q13156 261 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 OLIG2Q13516 323 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 IHHQ14623 411 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 DEFB110Q30KQ9 67 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 BBS9Q3SYG4 887 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ZNF766Q5HY98 468 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 DAAM2Q86T65 1068 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 HM13Q8TCT9 377 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 AGAP11Q8TF27 550 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ISL2Q96A47 359 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 RNF32Q9H0A6 362 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 XKR8Q9H6D3 395 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ASB8Q9H765 288 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 FAM60AQ9NP50 221 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CUTCQ9NTM9 273 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 EURLQ9NYK6 297 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 OR6C2Q9NZP2 312 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 C3orf18Q9UK00 162 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 NPIPA1Q9UND3 350 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 JMJD1CQ15652 2540 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 HYKKA2RU49 373 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 FAM229AH3BQW9 127 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.634e-6■□□□□ 11.2
CBX1-204ENST00000444685 AURKAO14965 403 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 PRODHO43272 600 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ASNA1O43681 348 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 MFSD11O43934 449 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CLEC3AO75596 197 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SUN1O94901 812 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ALX3O95076 343 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ONECUT2O95948 504 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 EPOP01588 193 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 HEXBP07686 556 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 UGT2B7P16662 529 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 OR1D4P47884 311 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 EMP2P54851 167 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 FOXL2P58012 376 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CACNG1Q06432 222 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ZNF33BQ06732 778 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 KLC1Q07866 573 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 KIR2DS3Q14952 304 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 PDK1Q15118 436 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CEBPEQ15744 281 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SLC14A2Q15849 920 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 BCL7AQ4VC05 210 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 TM4SF20Q53R12 229 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ATG9BQ674R7 924 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 ACAD11Q709F0 780 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 CAMKMTQ7Z624 323 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 PAQR7Q86WK9 346 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 PRSS58Q8IYP2 241 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 GHDCQ8N2G8 530 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-204ENST00000444685 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms