RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 HYAL2Q12891 473 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DET1Q7L5Y6 550 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DPP9Q86TI2 863 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR151Q8TDV0 419 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT8Q8WV74 236 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A4Q9H015 551 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R3H8 397 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0513O60268 411 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QBP02746 253 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PFKMP08237 780 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGAMP11215 1152 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NFKB1P19838 968 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TIE1P35590 1138 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NPY2RP49146 381 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCR4P61073 352 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA3BQ13214 749 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 POU4F3Q15319 338 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TLK2Q86UE8 772 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB15Q8WXK1 588 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ST8SIA2Q92186 375 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 COPS4Q9BT78 406 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PRO3102Q9H379 93 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MALT1Q9UDY8 824 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A3O75751 556 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A5O76082 557 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FHP07954 510 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 HOXC8P31273 242 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 EVI2BP34910 448 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 UBE3AQ05086 875 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 BTN1A1Q13410 526 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RFX4Q33E94 735 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 XKRXQ6PP77 449 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RIT1Q92963 219 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 GIMAP5Q96F15 307 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NIPAL2Q9H841 368 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 BRD9Q9H8M2 597 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF121Q9H920 327 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SETD4Q9NVD3 440 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 VNN3Q9NY84 501 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GTL3 188 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00862A6NCI5 91 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD28O15084 1053 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA2O43678 99 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG13O75143 517 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ACADMP11310 421 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SULT1E1P49888 294 aa8.16□□□□□ -1.1
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