RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPESP1Q6UW49 350 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSC1A1Q92681 617 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CCT7Q99832 543 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM107BQ9H098 131 aa16.32■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 U3KQA8 63 aa16.32■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT6BP04259 564 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TYRP1P17643 537 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT6CP48668 564 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF33BQ06732 778 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CATSPEREQ5SY80 951 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF165Q6ZSG1 346 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT78Q8N1N4 520 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4K1Q8NGD4 311 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2E3Q969T4 207 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPHS2Q9NP85 383 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.31■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX7Q9UNH6 387 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX6Q9UNH7 406 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK4Q9Y5K2 254 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.31■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.3■□□□□ 0.2
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GUSBP11Q6P575 273 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA21Q7Z572 469 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNA7Q96RP8 456 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 NT5DC2Q9H857 520 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FIS1Q9Y3D6 152 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMM22Q9Y584 194 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FANCMQ8IYD8 2048 aa16.3■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0J9YY10 115 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPED1A4D0V7 1026 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 H7BY64 318 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 B4GAT1O43505 415 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFSF14O43557 240 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX3O60493 162 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ULK1O75385 1050 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYF5P13349 255 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRK3P35626 688 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1D5P58170 312 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAB2P98082 770 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT88Q13099 833 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SQSTM1Q13501 440 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRG2Q64ET8 278 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRED1Q7Z699 444 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAS2Q8IYD9 372 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CARFQ8N187 725 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 STON2Q8WXE9 905 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.29■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.29■□□□□ 0.2
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