RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 IL4I1Q96RQ9 567 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF347Q96SE7 839 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.335e-7■□□□□ 9.4
TMOD1-201ENST00000259365 DCSTAMPQ9H295 470 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 LHX3Q9UBR4 397 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TET1Q8NFU7 2136 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CDH23Q9H251 3354 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SPAM1P38567 509 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GRIK2Q13002 908 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CERS6Q6ZMG9 384 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZVU0 165 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SVOPLQ8N434 492 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SPATA17Q96L03 361 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CEP19Q96LK0 163 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TCF25Q9BQ70 676 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SLC32A1Q9H598 525 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf119Q9NWQ9 140 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GPR83Q9NYM4 423 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CDH7Q9ULB5 785 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 RAB23Q9ULC3 237 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FZD4Q9ULV1 537 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 A6NL46 340 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ARNTLO00327 626 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 STATHP02808 62 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 RCVRNP35243 200 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ALDH9A1P49189 494 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SPIBQ01892 262 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MXD1Q05195 221 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CCSMST1Q4G0I0 132 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DGKKQ5KSL6 1271 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CPZQ66K79 652 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 LAIR2Q6ISS4 152 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 NEK5Q6P3R8 708 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZVL8 140 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 BBS7Q8IWZ6 715 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CADM3Q8N126 398 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 NXPE1Q8N323 547 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SETD9Q8NE22 299 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PEX13Q92968 403 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TADA1Q96BN2 335 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 Q96MT0 163 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 RAD18Q9NS91 495 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM9Q9P0T7 183 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ENPP5Q9UJA9 477 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 BTBD3Q9Y2F9 522 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 OARD1Q9Y530 152 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TSC2P49815 1807 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PSMD11O00231 422 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TFECO14948 347 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SERPINB7O75635 380 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TGFB1P01137 390 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 STSP08842 583 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ACRV1P26436 265 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SERPINA4P29622 427 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 KDELR2P33947 212 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CD97P48960 835 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CLCN4P51793 760 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TAGAPQ8N103 731 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ALPK1Q96QP1 1244 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FEVQ99581 238 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 P2RY12Q9H244 342 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GORASP2Q9H8Y8 452 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TPT1P8Q9HAU6 139 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SGK2Q9HBY8 427 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM39Q9HCM9 518 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM161AQ9NX61 479 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 POU2F3Q9UKI9 436 aa13□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SUV39H1O43463 412 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 F11P03951 625 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 EBLN1P0CF75 366 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 HOXC8P31273 242 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PTGER1P34995 402 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 KRT20P35900 424 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MC1RQ01726 317 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CTF1Q16619 201 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF691Q5VV52 312 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FRG2Q64ET8 278 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SPATC1Q76KD6 591 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 NELL1Q92832 810 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FRG2BQ96QU4 278 aa12.99□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CLMPQ9H6B4 373 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms