RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q5EBG8 199 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam169aQ5XG69 665 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klhl23Q6GQU2 558 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpr139Q80UC8 345 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sra1Q80VJ2 232 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bbs4Q8C1Z7 520 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MmaaQ8C7H1 415 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cant1Q8VCF1 403 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Elmod3Q91YP6 381 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slco1a5Q91YY5 670 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ubox5Q925F4 539 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ggt7Q99JP7 662 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mcm8Q9CWV1 833 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Usp12Q9D9M2 370 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tas2r119Q9JKT2 335 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nupr1Q9WTK0 80 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21497A0A087WRK3 222 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rhbdl2A2AGA4 302 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm44G3UW88 330 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 C1dO35473 141 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pole2O54956 527 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 St3gal5O88829 414 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Folr1P35846 255 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc1a5P51912 553 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dok6Q2MHE5 331 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nt5eQ61503 576 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 HjurpQ6PG16 667 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mgat5bQ765H6 792 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf750Q8BH05 703 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam109aQ8BH49 266 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Irak2Q8CFA1 622 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr853Q8VGG6 305 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ppp6cQ9CQR6 305 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pou5f2Q9DAC9 329 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TesminQ9WTJ6 475 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc22a4Q9Z306 553 aa8.26□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm20911A0A087WSS0 222 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 A0A1L1ST33 502 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GmlE9PX31 176 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccl26F8VQM2 93 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mtnd4P03911 459 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gnao1P18872 354 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wbp2P97765 261 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rab33aP97950 237 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mageb5Q14AN0 366 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kcnh1Q60603 989 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdkn2cQ60772 168 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sema4aQ62178 760 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pik3r3Q64143 461 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdhga7Q6DD96 935 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 C1qtnf6Q6IR41 264 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nrde2Q80XC6 1172 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc5a11Q8K0E3 673 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr74Q8VCG3 384 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr448Q8VES9 310 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd209eQ91ZW7 208 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ak5Q920P5 562 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q9CR55 154 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 S100a14Q9D2Q8 104 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rai2Q9QVY8 529 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bard1O70445 765 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr5P61965 334 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mmp11Q02853 492 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 OgnQ62000 298 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gjc2Q8BQU6 440 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arhgef3Q91X46 524 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm26657Q9CVR1 127 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 2610042L04RikQ9D073 150 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Uqcrc2Q9DB77 453 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sertad3Q9ERC3 197 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1508Q9R0K4 310 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm8180E9PXN0 145 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 H2-AaP01910 256 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Myf6P15375 242 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bmpr1aP36895 532 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Elk4P41158 430 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scn2bQ56A07 215 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Amigo1Q80ZD8 492 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cpped1Q8BFS6 312 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Psmd11Q8BG32 422 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pomt2Q8BGQ4 820 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem72Q8C3K5 275 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q9CWU4 180 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr701Q9D3U9 316 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Chrnb2Q9ERK7 501 aa8.25□□□□□ -1.09
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Adam21Q9JI76 729 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms