RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LAMA4Q16363 1823 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SOGA1O94964 1423 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PMS2P1A4D2B8 440 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LRP5LA4QPB2 252 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 J3KR12 359 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SERPINA7P05543 415 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RETP07949 1114 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TRIM49P0CI25 452 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TRIM49CP0CI26 452 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ARAFP10398 606 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NCK1P16333 377 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DDCP20711 480 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC1A1P43005 524 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NT5C2P49902 561 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TUBP50607 506 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 EFNA5P52803 228 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MAPK10P53779 464 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC5A3P53794 718 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GRB2P62993 217 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ACTG1P63261 375 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ADAM17P78536 824 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ABHD18Q0P651 414 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PTPRCAPQ14761 206 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ATP6AP1Q15904 470 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NTRK2Q16620 822 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 UGCGQ16739 394 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF425Q6IV72 752 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SFXN4Q6P4A7 337 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DNM1P34Q6PK57 102 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GALNT5Q7Z7M9 940 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SYNE4Q8N205 404 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GALNT4Q8N4A0 578 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 COPS9Q8WXC6 57 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RSPRY1Q96DX4 576 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 BOD1Q96IK1 185 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RBP7Q96R05 134 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MAP3K14Q99558 947 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SENP7Q9BQF6 1050 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 FAIM2Q9BWQ8 316 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CDK19Q9BWU1 502 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RNF208Q9H0X6 261 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ELP3Q9H9T3 547 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 VTA1Q9NP79 307 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NUDT15Q9NV35 164 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 THYN1Q9P016 225 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KLHL13Q9P2N7 655 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR12D3Q9UGF7 316 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF639Q9UID6 485 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ADAM29Q9UKF5 820 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KIAA0232Q92628 1395 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 F5H5T6 163 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MDM4O15151 490 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SYNGR2O43760 224 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SNX3O60493 162 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SDC3O75056 442 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RPS6KA5O75582 802 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DGKIO75912 1065 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CNTN5O94779 1100 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CBX7O95931 251 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 IGHEP01854 428 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ADH4P08319 380 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CD63P08962 238 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DBHP09172 617 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PRPS2P11908 318 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ATP4AP20648 1035 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MAOBP27338 520 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ACSL1P33121 698 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 UGT2B10P36537 528 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LIPAP38571 399 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RAB4BP61018 213 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 USP46P62068 366 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PTP4A2Q12974 167 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PTK7Q13308 1070 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PEA15Q15121 130 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SMTNL2Q2TAL5 461 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 AGKQ53H12 422 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HECTD2Q5U5R9 776 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM268Q5VZI3 342 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CIAPIN1Q6FI81 312 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RANBP10Q6VN20 620 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC26A9Q7LBE3 791 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SNX29P2Q8IUI4 249 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LACC1Q8IV20 430 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms