RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 MT-ND2P03891 347 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 TNNI3P19429 210 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 HTR1EP28566 365 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 FOXM1Q08050 763 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RAPSNQ13702 412 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 SLC36A3Q495N2 470 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ZFAND4Q86XD8 727 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 OR2T29Q8NH02 315 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ISL2Q96A47 359 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 C8orf4Q9NR00 106 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RHCGQ9UBD6 479 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 HHLA1C9JL84 531 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ARHGEF9O43307 516 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ELFN1P0C7U0 828 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PSMD8P48556 350 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF614Q8N883 585 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ABHD11Q8NFV4 315 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 OR2T11Q8NH01 316 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 EGLN2Q96KS0 407 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PSKH2Q96QS6 385 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RMI1Q9H9A7 625 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 KLHL3Q9UH77 587 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 VPS51Q9UID3 782 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 GPSM3Q9Y4H4 160 aa10.1□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 A0A0G2JN53 185 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 FUOMA2VDF0 154 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 A8MU76 341 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 MANBAO00462 879 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 CCNKO75909 580 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 BCKDHAP12694 445 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 HPCAL1P37235 193 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PON2Q15165 354 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 TEAD2Q15562 447 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ADGRF1Q5T601 910 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 FAM171BQ6P995 826 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 BBS7Q8IWZ6 715 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 SVOPLQ8N434 492 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 NETO1Q8TDF5 533 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RAD9AQ99638 391 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 INPP5KQ9BT40 448 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 GIN1Q9NXP7 522 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 CD300AQ9UGN4 299 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ASB1Q9Y576 335 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 A8MV72 311 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 STX16O14662 325 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 TEX28O15482 410 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RXRGP48443 463 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 CNTN1Q12860 1018 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PDZK1Q5T2W1 519 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 KCNJ9Q92806 393 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 MYDGFQ969H8 173 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 PYURFQ96I23 114 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 C1orf74Q96LT6 269 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF382Q96SR6 550 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RTP3Q9BQQ7 232 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 CEP250Q9BV73 2442 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 DNTTP04053 509 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 FGF4P08620 206 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 TIE1P35590 1138 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 CDC42P60953 191 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 SMARCB1Q12824 385 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 RCAN2Q14206 197 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 MPPE1Q53F39 396 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 AKAP14Q86UN6 197 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 DEPDC7Q96QD5 511 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 NDOR1Q9UHB4 597 aa10.09□□□□□ -0.79
CTCFL-216ENST00000608263 TARM1B6A8C7 271 aa10.08□□□□□ -0.8
CTCFL-216ENST00000608263 H0YJX3 145 aa10.08□□□□□ -0.8
CTCFL-216ENST00000608263 M0R129 80 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81 ms