RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NIPSNAP2O75323 286 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MATN4O95460 622 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCNFP41002 786 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDC16Q13042 620 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCNG2Q16589 344 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LPGAT1Q92604 370 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAM136AQ96C01 138 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C8orf44Q96CB5 159 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MFSD3Q96ES6 412 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SYBUQ9NX95 663 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CROCCQ5TZA2 2017 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MYO9AB2RTY4 2548 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR2A25A4D2G3 310 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KLHL18O94889 574 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VAPBO95292 243 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HPP00738 406 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ERGP11308 486 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MGAT1P26572 445 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FMO4P31512 558 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MFAP5Q13361 173 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VWA2Q5GFL6 755 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ATG9BQ674R7 924 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CES3Q6UWW8 571 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPC24Q8NBT2 197 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COG1Q8WTW3 980 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MIEF2Q96C03 454 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FOPNLQ96NB1 174 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DPH7Q9BTV6 452 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KIFC1Q9BW19 673 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GALPQ9UBC7 116 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 H0YGG7 62 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EDN3P14138 238 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ACPPP15309 386 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ATP5DP30049 168 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NPY2RP49146 381 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OCA2Q04671 838 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TLR1Q15399 786 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MUM1Q2TAK8 710 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRTGQ2VWP7 1150 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAR1Q8WVX9 515 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VPS50Q96JG6 964 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BFARQ9NZS9 450 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C3orf18Q9UK00 162 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAP2K7O14733 419 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FFAR3O14843 346 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GPR42O15529 346 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRRTM2O43300 516 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ERVK-10P10266 1014 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COX6A1P12074 109 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CMPK1P30085 196 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KCNJ1P48048 391 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RPS6KA1Q15418 735 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR9A1PQ8NGU1 263 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PSMF1Q92530 271 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LMF1Q96S06 567 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SOX13Q9UN79 622 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.1 ms