RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548211.1

RPAP3-205, Transcript of RNA polymerase II associated protein 3, human

TSL 2

Gene RPAP3, Length 555 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPAP3-205	ENST00000548211	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	RUNX1T1	Q06455	604 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	TOMM20	Q15388	145 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	ALX1	Q15699	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	TSSK4	Q6SA08	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	GPR65	Q8IYL9	337 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	ERP27	Q96DN0	273 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	TBATA	Q96M53	351 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	MAP7D2	Q96T17	732 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	SDF4	Q9BRK5	362 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM160	Q9NX00	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPAP3-205	ENST00000548211	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ACACA	Q13085	2346 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	FRYL	O94915	3013 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	MAST4	O15021	2626 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	SYNGR3	O43761	229 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ECI2	O75521	394 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	AGR2	O95994	175 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TF	P02787	698 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	HOXA6	P31267	233 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	NAE1	Q13564	534 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC12A1	Q13621	1099 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM187	Q14656	261 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	LIN9	Q5TKA1	542 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TXNDC8	Q6A555	127 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	FAM228A	Q86W67	206 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	BEST3	Q8N1M1	668 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	METTL13	Q8N6R0	699 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	FAM3C	Q92520	227 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF653	Q96CK0	615 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ART5	Q96L15	291 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	SH3GL2	Q99962	352 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	GDE1	Q9NZC3	331 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ZMYM6	O95789	1325 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	NUP205	Q92621	2012 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TEX28	O15482	410 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	CTSV	O60911	334 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	RHOBTB1	O94844	696 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	IGLV1-44	P01699	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	CCDC192	P0DO97	292 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	TDGF1	P13385	188 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	HSD3B1	P14060	373 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	HOXA9	P31269	272 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	KIF5B	P33176	963 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	NUCB1	Q02818	461 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	GAGE5	Q13069	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPAP3-205	ENST00000548211	GAGE6	Q13070	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms