RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SEMA4D	Q92854	862 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PIGT	Q969N2	578 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TEKT1	Q969V4	418 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HMCES	Q96FZ2	354 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C3orf30	Q96M34	536 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DCLK3	Q9C098	648 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C4A	P0C0L4	1744 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC01553	A4QN01	128 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C5orf60	A6NFR6	353 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6C75	A6NL08	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	YDJC	A8MPS7	323 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RTN2	O75298	545 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINI2	O75830	405 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GAGE7	O76087	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KDM4B	O94953	1096 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV2-70	P01814	119 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GAGE12F	P0CL80	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM18	P0DKX4	95 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MYOD1	P15172	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CASP3	P42574	277 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ISL1	P61371	349 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GAGE1	Q13065	139 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GAGE4	Q13068	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RPA4	Q13156	261 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HFE	Q30201	348 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PIGB	Q92521	554 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MTERF3	Q96E29	417 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SCMH1	Q96GD3	660 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD9A	Q99638	391 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CDH20	Q9HBT6	801 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MIOS	Q9NXC5	875 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF580	Q9UK33	172 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NFAT5	O94916	1531 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HYKK	A2RU49	373 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR137B	O60478	399 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FCGR3B	O75015	233 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	BMP10	O95393	424 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	WDPCP	O95876	746 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC16A8	O95907	504 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PNP	P00491	289 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LDLR	P01130	860 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	INHBA	P08476	426 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PSG1	P11464	419 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ITIH1	P19827	911 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PTGER4	P35408	488 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NME5	P56597	212 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	STX1B	P61266	288 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ST8SIA6	P61647	398 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SYT14P1	Q58G82	188 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	XKR9	Q5GH70	373 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB12	Q6IQ22	244 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD9	Q7L273	389 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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