RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 OOSP2Q86WS3 158 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 TGM7Q96PF1 710 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ZMYND15Q9H091 742 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF839A8K0R7 811 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 GFRA3O60609 400 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH1P12830 882 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 EPB42P16452 691 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CKMT2P17540 419 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CSF2RBP32927 897 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPZBP47756 277 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC16Q13042 620 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 STX3Q13277 289 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCG4Q9H172 646 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQM1 296 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 VARSP26640 1264 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR3P46089 330 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKAA1Q13131 559 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF225Q9UK10 706 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SH3BP2P78314 561 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 NR1D2Q14995 579 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ICE2Q659A1 982 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2L3Q8NG85 312 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP54Q96N23 3096 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf74A8MZ97 194 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 H7BY64 318 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC1A6P48664 564 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 PIK3CGP48736 1102 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 RCN2Q14257 317 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SYVN1Q86TM6 617 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 DEFB124Q8NES8 71 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 NAT6Q93015 286 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNA7Q96RP8 456 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 DRC3Q9H069 523 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF11Q9Y3C5 154 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 EPHA4P54764 986 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVPABLB-1P60509 514 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 ASPHQ12797 758 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 KIR2DS3Q14952 304 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SPESP1Q6UW49 350 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 LCTLQ6UWM7 567 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 PLD3Q8IV08 490 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEB18Q96M61 343 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 FIS1Q9Y3D6 152 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM186AA6NE01 2351 aa21.89■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 RP1P56715 2156 aa21.89■■□□□ 1.1
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM233B4DJY2 109 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 HSPA4LO95757 839 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CD22P20273 847 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CCND1P24385 295 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 GRIA3P42263 894 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNG1P51959 295 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXA1P55317 472 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN6P56747 220 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CHIT1Q13231 466 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 XKR6Q5GH73 641 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 LETMD1Q6P1Q0 360 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ADCK2Q7Z695 626 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 C17orf64Q86WR6 236 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4F6Q8NGB9 312 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CNDP1Q96KN2 507 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 SORT1Q99523 831 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K3Q99759 626 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms