RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SPESP1Q6UW49 350 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM135Q86UB9 458 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HORMAD1Q86X24 394 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR8H2Q8N162 312 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SHDQ96IW2 340 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GON7Q9BXV9 100 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NUP50Q9UKX7 468 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TRIP11Q15643 1979 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PPP6CO00743 305 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AHSGP02765 367 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CEBPBP17676 345 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC26A3P40879 764 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35A2P78381 396 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF45Q02386 682 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ITFG1Q8TB96 612 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PLD4Q96BZ4 506 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 P2RY11Q96G91 374 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DEC1Q9P2X7 70 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ACOT9Q9Y305 439 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 U3KQV3 271 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SMLR1H3BR10 107 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KCNK1O00180 336 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NMBRP28336 390 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RAD51Q06609 339 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CTBP1Q13363 440 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NFYCQ13952 458 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PDGFRLQ15198 375 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NKG7Q16617 165 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 Q96MT0 163 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TBCBQ99426 244 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GLTPQ9NZD2 209 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0B4J293 547 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HMX3A6NHT5 357 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PDPK1O15530 556 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PDGFAP04085 211 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RHOCP08134 193 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MSH3P20585 1137 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 GADD45AP24522 165 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 VIPR2P41587 438 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PRKCDQ05655 676 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RAB43Q86YS6 212 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FLCNQ8NFG4 579 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf60Q96EN9 201 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RNF31Q96EP0 1072 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SP110Q9HB58 689 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CFL2Q9Y281 166 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SCN1AP35498 2009 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DFFAO00273 331 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 AIREO43918 545 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CNTN5O94779 1100 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MAPK12P53778 367 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FAPQ12884 760 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF567Q8N184 647 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2FQ969M7 185 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM80Q96HE8 168 aa9.83□□□□□ -0.84
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