RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518043.5

CPS1-210, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CPS1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-210ENST00000518043 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 ACSS2Q9NR19 701 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 COPG2Q9UBF2 871 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PI4KAP42356 2102 aa6.7□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 WDR91A4D1P6 747 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 MGAT4DA6NG13 374 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 E5RI56 91 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 GFYI3L273 518 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 UBXN8O00124 270 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 BTN3A1O00481 513 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 FPGTO14772 594 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 KLF11O14901 512 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 BIRC5O15392 142 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 MAGEC1O60732 1142 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 RASGRP1O95267 797 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 MATN4O95460 622 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 FTH1P02794 183 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 GPR89BP0CG08 455 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 TPBGLP0DKB5 382 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 MPC1LP0DKB6 136 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 RALBP11234 206 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 CPA3P15088 417 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 DRD4P21917 467 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 ACADLP28330 430 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PDHA2P29803 388 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 SEC24CP53992 1094 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 IL2P60568 153 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 ATP6V0D1P61421 351 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 NFKB2Q00653 900 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 OCRLQ01968 901 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 DMPKQ09013 629 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 BST1Q10588 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 FZD2Q14332 565 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 GRB7Q14451 532 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 NFE2L1Q14494 772 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 ALG11Q2TAA5 492 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 CCDC153Q494R4 210 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 HHATQ5VTY9 493 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 LAYNQ6UX15 382 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 RPTNQ6XPR3 784 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 LSMEM2Q8N112 164 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 DEFB119Q8N690 84 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 OR2L2Q8NH16 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 RDH11Q8TC12 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 ELMO1Q92556 727 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 MAGEB18Q96M61 343 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 TMEM237Q96Q45 408 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 PANX3Q96QZ0 392 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 IPPKQ9H8X2 491 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 OXSMQ9NWU1 459 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 GPR34Q9UPC5 381 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 DMTF1Q9Y222 760 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 CACNA1HO95180 2353 aa6.69□□□□□ -1.34
CPS1-210ENST00000518043 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.69□□□□□ -1.34
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