RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC16A	O15027	2179 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFHX3	Q15911	3703 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087X0T9	212 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GX78	115 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ISM1	B1AKI9	464 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SOCS6	O14544	535 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH17	O14917	1159 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HCRTR1	O43613	425 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM228B	P0C875	321 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNT1	P13805	278 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGAL	P20701	1170 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CD151	P48509	253 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSF	P54793	590 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZIC1	Q15915	447 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP10	Q96AY3	582 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OLFM3	Q96PB7	478 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	LMF1	Q96S06	567 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ASF1A	Q9Y294	204 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM221A	A4D161	298 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2K7	O14733	419 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM1A	O60341	852 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINC1	P01008	464 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PDHA2	P29803	388 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SMS	P52788	366 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCC	Q00597	558 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MPP3	Q13368	585 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	INA	Q16352	499 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NKG7	Q16617	165 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2A14	Q96R47	310 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CRB3	Q9BUF7	120 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FICD	Q9BVA6	458 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR54	Q9H977	334 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ICK	Q9UPZ9	632 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MTOR	P42345	2549 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SMTNL1	A8MU46	457 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BMH7	237 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNN4	O15554	427 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SGTA	O43765	313 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	USP1	O94782	785 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL18	O94889	574 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SLITRK5	O94991	958 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	RASAL1	O95294	804 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CRTAM	O95727	393 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	F10	P00742	488 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN3	P20807	821 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PBX1	P40424	430 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CA7	P43166	264 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRA4	P48169	554 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NR2C2	P49116	596 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TDGF1P3	P51864	188 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	RPA4	Q13156	261 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD3	Q15059	726 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SYTL3	Q4VX76	610 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KAZN	Q674X7	775 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		10.36	□□□□□ -0.75

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