RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	C2orf81	A6NN90	581 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	FAM86B1	E9PN63	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ARPC2	O15144	300 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ATP6V0E1	O15342	81 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	SNX3	O60493	162 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	PGLS	O95336	258 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	TGDS	O95455	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	GSR	P00390	522 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	SPP1	P10451	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CDH3	P22223	829 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ATP5D	P30049	168 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	SOAT1	P35610	550 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	MFAP3	P55082	362 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	MTCP1	P56278	107 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CLDN15	P56746	228 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	GSDMD	P57764	484 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	TAF10	Q12962	218 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	PTGIS	Q16647	500 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF876P	Q49A33	203 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ISCA2	Q86U28	154 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	MMD2	Q8IY49	270 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	OR52N5	Q8NH56	324 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	PIGB	Q92521	554 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	SLC7A4	O43246	635 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	AMBP	P02760	352 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	EDN1	P05305	212 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	COPB2	P35606	906 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	VAMP7	P51809	220 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	PTEN	P60484	403 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	UGP2	Q16851	508 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	OR4A47	Q6IF82	309 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	NOTUM	Q6P988	496 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF383	Q8NA42	475 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	DNASE1L2	Q92874	299 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	EXOC4	Q96A65	974 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	LGALS12	Q96DT0	336 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	PGM2	Q96G03	612 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	DESI2	Q9BSY9	194 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CPVL	Q9H3G5	476 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	TLE6	Q9H808	572 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	VPS18	Q9P253	973 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CDH7	Q9ULB5	785 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	STUB1	Q9UNE7	303 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	C2CD2	Q9Y426	696 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	RIPK3	Q9Y572	518 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	OOEP	A6NGQ2	149 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454		H0YAE9	185 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	SLC30A4	O14863	429 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	SLC22A2	O15244	555 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	RLN1	P04808	185 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CFC1	P0CG37	223 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	RNF224	P0DH78	156 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ERVK-10	P10266	1014 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	EPOR	P19235	508 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	ITGA3	P26006	1051 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	3.72	□□□□□ -1.81
CLK1-208	ENST00000464454	E2F5	Q15329	346 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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