RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454741.5

TTC28-AS1-219, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,064 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KDELR3O43731 214 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NOBOXO60393 691 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UGT1A6P19224 532 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UGT1A1P22309 533 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UGT1A4P22310 534 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GRIA1P42261 906 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 APLP1P51693 650 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SMSP52788 366 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STC1P52823 247 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HMGCS1Q01581 520 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RBBP4Q09028 425 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NPTX1Q15818 432 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ELOA3Q8NG57 546 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MEMO1Q9Y316 297 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC42Q9Y546 428 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ITM2AO43736 263 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FESP07332 822 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NRG3P56975 720 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF384Q8TF68 577 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 THRSPQ92748 146 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KCNJ9Q92806 393 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RDH12Q96NR8 316 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EPYCQ99645 322 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MXD1Q05195 221 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SEMA3AQ14563 771 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MYLK3Q32MK0 819 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TLR4O00206 839 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACOX3O15254 700 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRKD3O94806 890 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF3P17036 446 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STON2Q8WXE9 905 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC22A4Q9H015 551 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GALPQ9UBC7 116 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PHF24Q9UPV7 400 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MANBAO00462 879 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DCLK1O15075 740 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FAM189A1O60320 539 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TSPAN9O75954 239 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 S100A6P06703 90 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PDX1P52945 283 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CDK6Q00534 326 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TLE2Q04725 743 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NCSTNQ92542 709 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TSGA13Q96PP4 275 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AGRPO00253 132 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CKMT2P17540 419 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC107Q8WV48 283 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EBF2Q9HAK2 575 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 INSL6Q9Y581 213 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF536O15090 1300 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 A0A1W2PRU2 124 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARL6IP5O75915 188 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TBX18O95935 607 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HOXC12P31275 282 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RFC2P35250 354 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TLR1Q15399 786 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARSIQ5FYB1 569 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms