RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 METRNLQ641Q3 311 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 MACC1Q6ZN28 852 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZPA2 131 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 AZIN2Q96A70 460 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 C5orf34Q96MH7 638 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 TEX101Q9BY14 249 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 CISHQ9NSE2 258 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 COX16Q9P0S2 106 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 CLIC4Q9Y696 253 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 SRCP12931 536 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 KRT13P13646 458 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 PRF1P14222 555 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 PGM1P36871 562 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 PLK1P53350 603 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.691e-6■■■■□ 21.5
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PTPRK-210ENST00000415055 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 C22orf39Q6P5X5 142 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRK-210ENST00000415055 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 RRAGAQ7L523 313 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 TAC4Q86UU9 113 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 DTX2Q86UW9 622 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-210ENST00000415055 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.49□□□□□ -1.69
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