RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFS2O75306 463 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 RASGRP1O95267 797 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 NPPAP01160 153 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PRPS2P11908 318 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 RAP1GDS1P52306 607 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 MXRA7P84157 204 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 RIPK1Q13546 671 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 XKR6Q5GH73 641 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM198Q66K66 360 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 RINLQ6ZS11 566 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZSR6 202 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SFRP1Q8N474 314 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 KYQ8NBH2 561 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 PYCR2Q96C36 320 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 BIRC7Q96CA5 298 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 MED8Q96G25 268 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SPACA7Q96KW9 195 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 C12orf66Q96MD2 445 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 C1orf109Q9NX04 203 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 BTRCQ9Y297 605 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.48□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.47□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A3O75751 556 aa9.47□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 RASSF9O75901 435 aa9.47□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 PIK3CBP42338 1070 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CXCL12P48061 93 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 RAB28P51157 221 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN2P57739 230 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 TBPL1P62380 186 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PHEXP78562 749 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ABATP80404 500 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 DOC2AQ14183 400 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 KRT33BQ14525 404 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 KIF19Q2TAC6 998 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 AGKQ53H12 422 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.47□□□□□ -0.89
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