RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD6P30203 668 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FMO4P31512 558 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 WASP42768 502 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 RXRGP48443 463 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP4BP51164 291 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDH15P55291 814 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTSQ03393 145 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 DPTQ07507 201 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MERTKQ12866 999 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 INPP5AQ14642 412 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGERQ15109 404 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFB124Q8NES8 71 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR2T3Q8NH03 318 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CIB1Q99828 191 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CTRCQ99895 268 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 P2RY12Q9H244 342 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MUC13Q9H3R2 512 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PARVBQ9HBI1 364 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CAPN10Q9HC96 672 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCTD3Q9Y597 815 aa9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 EML5Q05BV3 1969 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRRT4C9JH25 899 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEMP1O14524 444 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 STX16O14662 325 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 AREL1O15033 823 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC16A5O15375 505 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 KERAO60938 352 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 EPHX1P07099 455 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 ALPIP09923 528 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 MSH3P20585 1137 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 MMP12P39900 470 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PIK3CGP48736 1102 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEK2P51955 445 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 BNIP2Q12982 314 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PMS2P3Q13401 168 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP1A4Q13733 1029 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRP8Q14114 963 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 CSHL1Q14406 222 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP6AP1Q15904 470 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR107Q5VW38 600 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 OGFOD2Q6N063 350 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPRED1Q7Z699 444 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PIP4P1Q86T03 277 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PELI3Q8N2H9 469 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 FRMD1Q8N878 549 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNX31Q8N9S9 440 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 S100ZQ8WXG8 99 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 TAMM41Q96BW9 452 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 ROPN1LQ96C74 230 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 HMG20AQ9NP66 347 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSME2Q9UL46 239 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.7□□□□□ -0.86
APOBEC3G-201ENST00000407997 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms