RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 LINC00696Q6ZRV3 163 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 HOOK3Q86VS8 718 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 IQCA1Q86XH1 822 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL7Q8IXQ5 586 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 EID3Q8N140 333 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 STPG4Q8N801 248 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 SEPT1Q8WYJ6 367 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 RIT1Q92963 219 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 P2RX5Q93086 422 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K3Q99759 626 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 OR2B2Q9GZK3 357 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DNAI2Q9GZS0 605 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 SNX25Q9H3E2 840 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MINDY3Q9H8M7 445 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PRDM4Q9UKN5 801 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 LIPT1Q9Y234 373 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 IGSF1Q8N6C5 1336 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 FLRT2O43155 660 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 ST8SIA3O43173 380 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 LMX1BO60663 402 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SLC22A3O75751 556 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 PLGP00747 810 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 C9P02748 559 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 RLN1P04808 185 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 GP1BBP13224 206 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 ITGA3P26006 1051 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SOAT1P35610 550 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 KCNJ1P48048 391 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 HERC3Q15034 1050 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 P2RY6Q15077 328 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 STPG1Q5TH74 334 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CYB5D1Q6P9G0 228 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 BTNL8Q6UX41 500 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 GBP6Q6ZN66 633 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SLC26A9Q7LBE3 791 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 AMIGO1Q86WK6 493 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 C4orf19Q8IY42 314 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC170Q8IYT3 715 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 APCDD1Q8J025 514 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 NUP93Q8N1F7 819 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 UXS1Q8NBZ7 420 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 GRK7Q8WTQ7 553 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM143Q96AN5 459 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 PYCR2Q96C36 320 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 LMLNQ96KR4 655 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 UHRF2Q96PU4 802 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 FUT8Q9BYC5 575 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SHARPINQ9H0F6 387 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CPVLQ9H3G5 476 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 ACTL8Q9H568 366 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 TUFT1Q9NNX1 390 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SIX2Q9NPC8 291 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF580Q9UK33 172 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SCN5AQ14524 2016 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 C2CD4DB7Z1M9 353 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 F8VVB4 439 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 F8VWA3 439 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF197O14709 1029 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 FMO6PO60774 539 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 DFFBO76075 338 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 DDHD2O94830 711 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 BAG3O95817 575 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 IGLV2-11P01706 119 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 SERPING1P05155 500 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 STAG3L1P0CL83 205 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 EEF2P13639 858 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 TIMP3P35625 211 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 HERV-K104P61576 105 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 PHEXP78562 749 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 GCNT1Q02742 428 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-205ENST00000391970 CACNG1Q06432 222 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms