RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpm6Q8CIR4 2028 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc25a54B1AUS6 473 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp964B2RR88 472 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Izumo4D3Z690 227 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm28043E0CXC2 719 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r88E9Q235 316 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Xkr6E9Q6C8 638 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinb9eO08806 377 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hcn3O88705 779 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Svs4P18419 113 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Esr1P19785 599 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PnpP23492 289 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxd12P23812 268 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 UoxP25688 303 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pxmp2P42925 194 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpina7P61939 418 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aup1P70295 410 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Masp1P98064 704 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sox4Q06831 440 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam98aQ3TJZ6 515 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt2Q3TTY5 707 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Axdnd1Q3UZ57 424 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pacs2Q3V3Q7 862 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SynaQ5G5D5 617 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf43Q5NCP0 784 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc10a7Q5PT53 340 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AbrQ5SSL4 859 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf145Q5SWK7 663 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbccd1Q640P7 552 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kir3dl2Q673W2 388 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim17Q7TPM3 477 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hfe2Q7TQ32 420 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr845Q7TRG2 312 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AftphQ80WT5 931 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Efr3aQ8BG67 819 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxo9Q8BK06 437 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chrnb3Q8BMN3 464 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Irak3Q8K4B2 609 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abhd4Q8VD66 342 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Map3k21Q8VDG6 1002 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Recql5Q8VID5 982 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhga11Q91XY8 933 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc35b2Q91ZN5 431 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gtpbp3Q923K4 492 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mta3Q924K8 591 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd7Q9D504 279 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hormad1Q9D5T7 392 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Armc1Q9D7A8 282 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 2010005H15RikQ9D8D6 97 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Efhc1Q9D9T8 648 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uba7Q9DBK7 977 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr706Q9EPF8 316 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HemgnQ9ERZ0 503 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TescQ9JKL5 214 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tagln3Q9R1Q8 199 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc22a4Q9Z306 553 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 F8Q06194 2319 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CenpfE9Q3P4 2997 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DmdP11531 3678 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam131cA2ADB2 273 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ajm1A2AJA9 974 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1253A2AUA2 318 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptar1E9QAB6 424 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm4775F7ANJ3 135 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r61L7N2B8 865 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Neu1O35657 409 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chil3O35744 398 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Elovl3O35949 271 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dsg2O55111 1122 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Best1O88870 551 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Matn4O89029 624 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P06324 132 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fcgr2P08101 330 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ApoeP08226 311 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 JunbP09450 344 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp60P16374 707 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxb9P20615 250 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TfamP40630 243 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gdi1P50396 447 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccng1P51945 294 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Map3k7clP58500 142 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 S100a5P63084 93 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dusp2Q05922 318 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxc4Q08624 264 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.1 ms