RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp26P10076 861 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdh4P39038 913 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CratP47934 626 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccr3P51678 359 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Arhgef9Q3UTH8 516 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spin1Q61142 262 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wnk4Q80UE6 1222 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 RinlQ80UW3 563 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gstm7Q80W21 218 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rspo2Q8BFU0 243 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Igdcc3Q8BQC3 813 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AopepQ8BXQ6 817 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Coq9Q8K1Z0 313 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ttc4Q8R3H9 386 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Abtb1Q99LJ2 478 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NwcQ9CQI4 244 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prr23a3Q9CWP9 254 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nt5c3aQ9D020 331 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Arl5bQ9D4P0 179 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bmp10Q9R229 421 aa6.96□□□□□ -1.29
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp952B0V2W4 504 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ifit3bE9PV48 403 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr319L7MTY4 306 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mgat1P27808 447 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rps15aP62245 130 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 VegfaQ00731 214 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc35f3Q1LZI2 421 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 C130050O18RikQ497Y9 356 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kctd8Q50H33 476 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trav6-2Q5R1I4 113 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Irf4Q64287 450 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ParpbpQ6IRT3 573 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Klhdc10Q6PAR0 439 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mapre3Q6PER3 281 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr151Q7TSN6 422 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc18a2Q8BRU6 517 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mrgpra2Q91WW4 305 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Creb3l3Q91XE9 479 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mrm1Q99J25 320 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Psat1Q99K85 370 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc19a3Q99PL8 488 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ssr2Q9CPW5 183 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rbm18Q9CR83 190 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Asb1Q9WV74 336 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 A0A1Y7VIU7 259 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mcf2A2AEU1 1111 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fam71aB7XG49 585 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 A630073D07RikE9PWS6 100 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r28L7N203 852 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r169L7N275 304 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ItgalP24063 1163 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CtskP55097 329 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lsmem1Q3UQS2 128 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrig2Q52KR2 1054 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 St8sia1Q64687 355 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q6DFW0 481 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q8CDN1 933 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Washc1Q8VDD8 475 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1414Q8VGU5 312 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q91W34 466 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Catsper1Q91ZR5 686 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TcimQ9D915 106 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ube4bQ9ES00 1173 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trpm6Q8CIR4 2028 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3636E9Q5P1 227 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3460E9QAI8 215 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tp63O88898 680 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dnajb5O89114 348 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CapzbP47757 277 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Eml1Q05BC3 814 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc9b2Q5BKR2 547 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nr1h4Q60641 488 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rundc3bQ6PDC0 408 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prl3a1Q78Y73 227 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1307Q7TQX1 312 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Abhd13Q80UX8 337 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gen1Q8BMI4 908 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MaobQ8BW75 520 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Peli3Q8BXR6 445 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zmiz2Q8CIE2 920 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TwnkQ8CIW5 685 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Klhl36Q8R124 613 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrrc49Q91YK0 686 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ska1Q9CPV1 254 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cisd2Q9CQB5 135 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Apopt1Q9CQW7 192 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 H2afb2S4R1M3 115 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lamb2Q61292 1799 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc8-201ENSMUST00000025177 D7Ertd443eD2J0Y4 644 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.4 ms