RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 HACD3Q9P035 362 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SATB2Q9UPW6 733 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A088AWK7 358 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEA13PA6NCF6 341 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT87PA6NCN2 255 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 DKK1O94907 266 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CLCNKAP51800 687 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1CAP62136 330 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 HHEXQ03014 270 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CDH17Q12864 832 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC16Q13042 620 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBB3Q13509 450 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CAMK2BQ13554 666 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA5AQ13591 1074 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CLCA4Q14CN2 919 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 TBCCQ15814 346 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 STON2Q8WXE9 905 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PMEPA1Q969W9 287 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PLIN3O60664 434 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE5AO76074 875 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM16O95361 564 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GOT2P00505 430 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 RPIAP49247 311 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 DCDC1P59894 354 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CFHR1Q03591 330 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 TMED1Q13445 227 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PCLAFQ15004 111 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 RAPH1Q70E73 1250 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 MAVSQ7Z434 540 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRED1Q7Z699 444 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf107Q8IVU9 208 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SUN5Q8TC36 379 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PNPOQ9NVS9 261 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD5Q9NXV2 234 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 TOR1BO14657 336 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GLRA3O75311 464 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PDHA2P29803 388 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ARRB2P32121 409 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SHC2P98077 582 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GTF2H3Q13889 308 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC14A2Q15849 920 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ISXQ2M1V0 245 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 TIFABQ6ZNK6 161 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP206Q8IYR0 622 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 HIPK4Q8NE63 616 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 NCSTNQ92542 709 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKL2Q92772 493 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ECSITQ9BQ95 431 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf21Q9H246 121 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ARNT2Q9HBZ2 717 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF358Q9NW07 568 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 BRINP1O60477 761 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PROCP04070 461 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 LYNP07948 512 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGA2BP08514 1039 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GLB1P16278 677 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTFP26441 200 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CSF2RBP32927 897 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC19A1P41440 591 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 C4orf22Q6V702 233 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 NXPE1Q8N323 547 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GLMNQ92990 594 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC38A3Q99624 504 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC100653049A0A140TA62 436 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT34O76011 436 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 VAPBO95292 243 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGALP20701 1170 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 FDFT1P37268 417 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCG1P45844 678 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PGGT1BP53609 377 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 INHBCP55103 352 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 POLE2P56282 527 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GABREP78334 506 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKG2Q13237 762 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 IYDQ6PHW0 289 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CMC1Q7Z7K0 106 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SFRP1Q8N474 314 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 EFCAB3Q8N7B9 438 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR150Q8NGU9 434 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms