RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	CAPN2	P17655	700 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	MSH3	P20585	1137 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	MMP15	P51511	669 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ARSE	P51690	589 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ATP12A	P54707	1039 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	MLLT10	P55197	1068 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	GNB1	P62873	340 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	NUCB1	Q02818	461 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	SLC39A6	Q13433	755 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	GRAP	Q13588	217 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	DLG2	Q15700	870 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	NME8	Q8N427	588 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CENPO	Q9BU64	300 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	USP34	Q70CQ2	3546 aa		3.13	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ADAMDEC1	O15204	470 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	LIPF	P07098	398 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ADRB2	P07550	413 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	VPREB1	P12018	145 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	HOXD10	P28358	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PSMC4	P43686	418 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	NR2C2	P49116	596 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	LMAN1	P49257	510 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	HILS1	P60008	231 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CD81	P60033	236 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	SIRPA	P78324	504 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PRKCZ	Q05513	592 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	FCN2	Q15485	313 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	KRT74	Q7RTS7	529 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	OR8H2	Q8N162	312 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	STPG4	Q8N801	248 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	MCU	Q8NE86	351 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	APPL2	Q8NEU8	664 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PRSS33	Q8NF86	280 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	TM9SF4	Q92544	642 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	SERINC2	Q96SA4	455 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ABHD1	Q96SE0	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PFAS	O15067	1338 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PLK4	O00444	970 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	P4HA2	O15460	535 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	NDUFS4	O43181	175 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB43	O43298	467 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PCDH7	O60245	1069 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	CD48	P09326	243 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COX11-208	ENST00000576084	PRSS56	P0CW18	603 aa		3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms