RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A2	P36021	539 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCNKA	P51800	687 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GCNT1	Q02742	428 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EGR4	Q05215	589 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC18A2	Q05940	514 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SPOCK1	Q08629	439 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SREBF2	Q12772	1141 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OVGP1	Q12889	678 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SPP2	Q13103	211 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RAPSN	Q13702	412 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CEBPE	Q15744	281 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DPYSL2	Q16555	572 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ME3	Q16798	604 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NADK2	Q4G0N4	442 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IFI44L	Q53G44	452 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC38	Q5VT99	294 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM198	Q66K66	360 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX38	Q6PEX7	206 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMC8	Q8IU68	726 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CADM3	Q8N126	398 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	BBS5	Q8N3I7	341 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF148	Q8N7C7	305 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF611	Q8N823	705 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	BEST2	Q8NFU1	509 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GANC	Q8TET4	914 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAR1	Q8WVX9	515 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NSMAF	Q92636	917 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KAT2A	Q92830	837 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	INPP5D	Q92835	1189 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RIT1	Q92963	219 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IGSF8	Q969P0	613 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	WBP2	Q969T9	261 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL8	Q96CD0	374 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NXNL1	Q96CM4	212 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC51	Q96ER9	411 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DTD2	Q96FN9	168 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EGLN2	Q96KS0	407 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA13	Q96N96	652 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PANX3	Q96QZ0	392 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF347	Q96SE7	839 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPHS2	Q99611	448 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CCT7	Q99832	543 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT27	Q9BW83	186 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CDT1	Q9H211	546 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HIPK3	Q9H422	1215 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	COG4	Q9H9E3	785 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FZD3	Q9NPG1	666 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL1	Q9NR64	748 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL15	Q9NXU5	204 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SUN2	Q9UH99	717 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX6	Q9UNH7	406 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR132	Q9UNW8	380 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0U1RQF3	1178 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CPED1	A4D0V7	1026 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KLRF2	D3W0D1	207 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YGN5	161 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PLK4	O00444	970 aa		2.69	□□□□□ -1.98

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