RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	EPB42	P16452	691 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	KCNA4	P22459	653 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	CD1C	P29017	333 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	CMPK1	P30085	196 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC6A12	P48065	614 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	SERPINB4	P48594	390 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	PRKAA2	P54646	552 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	CCL7	P80098	99 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	ABAT	P80404	500 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	PCLAF	Q15004	111 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	PDK4	Q16654	411 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	LIPM	Q5VYY2	423 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	SPESP1	Q6UW49	350 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	USP53	Q70EK8	1073 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	C17orf64	Q86WR6	236 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	TGM7	Q96PF1	710 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	SGPP1	Q9BX95	441 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	OXSM	Q9NWU1	459 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	POMT2	Q9UKY4	750 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ABCD4-223	ENST00000555904	TLCD2	A6NGC4	264 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	GIPC1	O14908	333 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	CLGN	O14967	610 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	TAPBP	O15533	448 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	TRIM13	O60858	407 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	SUPT7L	O94864	414 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	SBK3	P0C264	359 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	UGT2B7	P16662	529 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	GNAZ	P19086	355 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	IMPDH1	P20839	514 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	CDH3	P22223	829 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	PLA2G5	P39877	138 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	GDF5	P43026	501 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	ETV4	P43268	484 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	ARL4D	P49703	201 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	AGTR2	P50052	363 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	DNAJB13	P59910	316 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	CDC16	Q13042	620 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	SQSTM1	Q13501	440 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	ICE2	Q659A1	982 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	LCTL	Q6UWM7	567 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	CARF	Q8N187	725 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	TEX9	Q8N6V9	391 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2L3	Q8NG85	312 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	NRTN	Q99748	197 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	KLHL3	Q9UH77	587 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A0J9YY10	115 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904		D6RAR5	112 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	MLYCD	O95822	493 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	BPGM	P07738	259 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	HRH2	P25021	359 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	PSMB5	P28074	263 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	ALDH3A1	P30838	453 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	CSF2RB	P32927	897 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	NAGLU	P54802	743 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	GTF2H2	Q13888	395 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	MPP2	Q14168	576 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	RBBP7	Q16576	425 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	ADCK2	Q7Z695	626 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ABCD4-223	ENST00000555904	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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