RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	GMPR	P36959	345 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	HSD17B2	P37059	387 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TLE3	Q04726	772 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NAB1	Q13506	487 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	BMPR2	Q13873	1038 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MANEA	Q5SRI9	462 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MROH9	Q5TGP6	573 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	RAPH1	Q70E73	1250 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	OR2L3	Q8NG85	312 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	OR1L3	Q8NH93	324 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MED8	Q96G25	268 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TCTN2	Q96GX1	697 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	DPH1	Q9BZG8	443 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ARL15	Q9NXU5	204 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TAC3	Q9UHF0	121 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ITPR1	Q14643	2758 aa		9.46	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024		E7ENX8	843 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SLC16A5	O15375	505 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NRP2	O60462	931 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ABCB7	O75027	752 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SCRG1	O75711	98 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ERG	P11308	486 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CMPK1	P30085	196 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ATP1A2	P50993	1020 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ITGA1	P56199	1179 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	RAB10	P61026	200 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CXADR	P78310	365 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TAP2	Q03519	686 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SP140	Q13342	867 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NAE1	Q13564	534 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CSHL1	Q14406	222 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	FCRL6	Q6DN72	434 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	DTX1	Q86Y01	620 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	RELL1	Q8IUW5	271 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NKD1	Q969G9	470 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC138	Q96M89	665 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	DPH7	Q9BTV6	452 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		9.45	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MGA	Q8IWI9	3026 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CTSV	O60911	334 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	OR2B3	O76000	313 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	KRT37	O76014	449 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	DLGAP3	O95886	979 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	INHBA	P08476	426 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MYBL2	P10244	700 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CALD1-223	ENST00000496024	MSH2	P43246	934 aa		9.44	□□□□□ -0.9

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